Белки
<<  Строение белка Рекомбинантные белки и пептиды  >>
Белки – пространственное строение и функции
Белки – пространственное строение и функции
Белки в организме
Белки в организме
Какой процент человеческого протеома имеет известную структуру
Какой процент человеческого протеома имеет известную структуру
Разнообразие белков
Разнообразие белков
Уровни структур белков
Уровни структур белков
Аминокислоты
Аминокислоты
Аминокислоты
Аминокислоты
Аминокислоты – боковые цепи
Аминокислоты – боковые цепи
Пептидные связи
Пептидные связи
Пептидные связи
Пептидные связи
Аминокислоты Боковые цепи
Аминокислоты Боковые цепи
Аминокислоты Боковые цепи
Аминокислоты Боковые цепи
Основные белковые структуры
Основные белковые структуры
Вторичная структура
Вторичная структура
Вторичная структура
Вторичная структура
Вторичная структура
Вторичная структура
A спираль - представление
A спираль - представление
Вторичные структуры
Вторичные структуры
Вторичные структуры
Вторичные структуры
B структуры - представление
B структуры - представление
Обратные повороты и петли
Обратные повороты и петли
Super secondary элементы: мотивы
Super secondary элементы: мотивы
Ramachandran Plot
Ramachandran Plot
Ramachandran Plot
Ramachandran Plot
Домены
Домены
Основные структуры белков
Основные структуры белков
Все – a 3D структуры
Все – a 3D структуры
-A/b 3D белковые структуры
-A/b 3D белковые структуры
?+? 3D белковые структуры
?+? 3D белковые структуры
Четвертичная структура
Четвертичная структура

Презентация на тему: «Белки – пространственное строение и функции». Автор: Porozov. Файл: «Белки – пространственное строение и функции.ppt». Размер zip-архива: 5283 КБ.

Белки – пространственное строение и функции

содержание презентации «Белки – пространственное строение и функции.ppt»
СлайдТекст
1 Белки – пространственное строение и функции

Белки – пространственное строение и функции

2 Белки в организме

Белки в организме

Белки составляют ~15% массы тела среднего человека. Функции белков: структурные белки, каталитические белки, транспорт и депо, регуляторные и рецепторные белки и белки иммунной системы (защитные), моторная и сократительная функции Большинство тканей тела состоит из белков. Многие болезни имеют причиной модификацию тех или иных белков.

3 Какой процент человеческого протеома имеет известную структуру

Какой процент человеческого протеома имеет известную структуру

Крупные фармацевтические компании выявили множество структур, но большинство из них не депонировано в Protein Data Bank. ~40,000 генов в человеческом геноме. ~25,000 записей в Protein Data Bank: a. ~5,600 точных записей хорошего качества. b. ~1,100 из них – человеческие белки c. И эти записи в основном – единичные домены или фрагменты белков. Ответ (эмпирический): ~1% Ответ (моделирование гомологов): ~20% доменов

4 Разнообразие белков

Разнообразие белков

Structures of Life

5 Уровни структур белков

Уровни структур белков

Первичная структура – последовательность аминокислот Вторичная структура – локальная организация полипептидной цепи без учёта возможных конформаций боковых цепей (R групп). Третичная структура – 3D структура всего протеина, включая конформации боковых цепей. Четвертичная структура – 3D структура организации субъединиц белка.

6 Аминокислоты

Аминокислоты

Гидрофобные боковые цепи

Гидрофильные боковые цепи

M

F

V

L

I

N

D

E

Q

R

H

K

S

G

A

Y

T

W (Two rings)

Y

C

P

-S- (SS-bonds in Cys)

Amide group

Positively charged

OH group (H-bonds)

Aromatic side chains

Negatively charged

7 Аминокислоты

Аминокислоты

Классы боковых цепей Аминокислоты Алифатические (без аром. связей) глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин. Гидроксил- или серосодержащие серин, треонин, цистеин, метионин Ароматические фенилаланин, тирозин, триптофан Основные гистидин, лизин, аргинин Кислые и амиды аспарагиновая кислота, глютаминовая кислота, аспарагин, глютамин Циклические пролин

8 Аминокислоты – боковые цепи

Аминокислоты – боковые цепи

9 Пептидные связи

Пептидные связи

Пептидная связь образуется в результате взаимодействия ? – углерода карбоксильной группы одной аминокислоты и ? –аминогруппы другой аминокислоты.

10 Пептидные связи

Пептидные связи

HDF5 format

Торзионный угол C,N,C?,C называется ?. Торзионный угол N,C?,C,N называется ?. Торзионный угол C? ,C,N,C? ) называется ?.

11 Аминокислоты Боковые цепи

Аминокислоты Боковые цепи

?-угол: торсионный угол, образованный атомами углерода боковой цепи

12 Аминокислоты Боковые цепи

Аминокислоты Боковые цепи

13 Основные белковые структуры

Основные белковые структуры

Первичная структура – последовательность аминокислот Вторичная структура – это локальная организация главной полипептидной цепи без учёта конформаций отдельных боковых групп (R групп).

14 Вторичная структура

Вторичная структура

a спираль (a helix)

H связь: N-H i -> C=O i+4 linus pauling, robert corey, max perutz

15 Вторичная структура

Вторичная структура

a спираль (a helix) Геометрия

Правозакрученная спираль. Каждая аминокислота соответствует повороту на 100° - 3,6 аминокислоты на виток и трансляции на 1,5 ? вдоль оси.

310 спираль – H связь: N-H i -> C=O i+3 Концы стандартной спирали

? спираль – H связь: N-H i -> C=O i+5

16 Вторичная структура

Вторичная структура

a спираль (a helix) Геометрия, углы

Торсионные углы, типичные для ?-спирали (?, ?) – -60°, -45°. Иными словами, сумма ? одной аминокислоты и ? следующей ~ -105°. Cумма углов 310 спирали ~ -75°, ?-спирали ~ -130°. Угол ?: 3cos?=1-4cos2((?+?)/2)

17 A спираль - представление

A спираль - представление

18 Вторичные структуры

Вторичные структуры

b структуры

B лист

William Astbury

19 Вторичные структуры

Вторичные структуры

b структуры Геометрия

Расстояние С?i – С?i+2 ~ 6? Расстояние между двумя нитями ~ 5? Углы: ? ~ -135°, ? ~ 135°

Антипараллельный лист

Параллельный лист

20 B структуры - представление

B структуры - представление

21 Обратные повороты и петли

Обратные повороты и петли

22 Super secondary элементы: мотивы

Super secondary элементы: мотивы

b-a-b

? изгибы

>2

? углы / ? изгибы /?-? углы

Спираль-поворот-спираль

23 Ramachandran Plot

Ramachandran Plot

Sasisekaharn – Ramakrishnan -Ramachandran plot отображает “допустимые” области для углов ? и ?. Повторяющиеся величины ? и ? вдоль пептидной цепи ? регулярные структуры.

24 Ramachandran Plot

Ramachandran Plot

?r - phi ~-57o и psi ~-47o.

? - phi ~-110->-140o и psi ~110->135o

cytochrome C-256

plastocyanin

25 Домены

Домены

Домен – элемент в протеине, свернутый независимо от белка, часто соединенный с подвижной, гибкой, бесструктурной частью. Домен – функциональный элемент белка. Эволюционно сохранившиеся элементы.

26 Основные структуры белков

Основные структуры белков

Третичная структура – 3D структура всего белка с учётом конформации боковых цепей. Четвертичная структура – 3D организация субъединиц (доменов) и белков в надмолекулярные комплексы

27 Все – a 3D структуры

Все – a 3D структуры

Все в спирали alamethicin

Связка из 4-х ? спиралей Ферритин

Спираль-поворот-спираль RNA-binding protein Rop

28 -A/b 3D белковые структуры

-A/b 3D белковые структуры

Сборка из ?-?-? единиц:

29 ?+? 3D белковые структуры

?+? 3D белковые структуры

Bacterial and mammalian pancreatic ribonucleases. Lysozome. Ubiquitin. Histidine-Carrier protein. Cysteine proteases such as papain and actinidin. Zinc Metallo-proteases. SH2 domains.

30 Четвертичная структура

Четвертичная структура

Wheat germ agglutin (9wga chain A)

«Белки – пространственное строение и функции»
http://900igr.net/prezentacija/biologija/belki-prostranstvennoe-stroenie-i-funktsii-207622.html
cсылка на страницу
Урок

Биология

136 тем
Слайды
900igr.net > Презентации по биологии > Белки > Белки – пространственное строение и функции