Общество
<<  Современные направления физкультурно-спортивной деятельности Выборы в современном обществе  >>
Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с
Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с
Субд
Субд
Эволюция СУБД
Эволюция СУБД
MS Access
MS Access
Paradox
Paradox
Oracle
Oracle
Microsoft SQL Server
Microsoft SQL Server
PostgreSQL
PostgreSQL
MySQL
MySQL
Delphi
Delphi
Visual FoxPro
Visual FoxPro
PHP
PHP
Паспортная база ГРР ВИР
Паспортная база ГРР ВИР
паспортная базы данных ВИР http://vir
паспортная базы данных ВИР http://vir
паспортная база данных ВИР http://vir
паспортная база данных ВИР http://vir
Европейская база сои
Европейская база сои
Проект GRIN-Global http://www
Проект GRIN-Global http://www
Проект GRIN-Global http://www
Проект GRIN-Global http://www
Проект GRIN-Global
Проект GRIN-Global
Статистические методы
Статистические методы
Ресурсы по статистике Электронный учебник по статистике от компании
Ресурсы по статистике Электронный учебник по статистике от компании
MS Excel
MS Excel
SPSS
SPSS
STATISTICA
STATISTICA
STATGRAPHICS
STATGRAPHICS
Статистические продукты GNU Project
Статистические продукты GNU Project
Специализированные программы и методы обработки результатов
Специализированные программы и методы обработки результатов
Программа NTSys
Программа NTSys
Программа DARwin
Программа DARwin
Спасибо за внимание
Спасибо за внимание

Презентация на тему: «Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений». Автор: Lyubov Novikova. Файл: «Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений.ppt». Размер zip-архива: 5046 КБ.

Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений

содержание презентации «Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений.ppt»
СлайдТекст
1 Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с

Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с

генетическими ресурсами растений

Л.Новикова, канд. техн. наук Зав. отд. информационно-технического обеспечения ВИР им. Н.И.Вавилова Санкт-Петербург l.novikova@vir.nw.ru

1

2 Субд

Субд

Система управления базами данных - программное обеспечение, с помощью которого пользователи могут определять, создавать и поддерживать базу данных, а также осуществлять к ней контролируемый доступ

Тип используемой СУБД определяется: типом используемой операционной системы; масштабом информационной системы: малые информационные системы могут использовать локальные СУБД (MS Excel (строго говоря, табличный процессор), MS Access, Corel Paradox, FoxPro) крупным требуется мощная клиент-серверная (или многоуровневая с использованием сервера приложений) СУБД, поддерживающая многопользовательскую работу. В настоящее время наиболее широко распространены реляционные СУБД (Oracle, MS SQL Server, MySQL, PostgreSQL). Они позволяют строить СУБД в виде системы взаимосвязанных двумерных таблиц. наблюдается тенденция к замещению локальных СУБД клиент-серверными и использующими Интернет – технологии новинка последних лет – облачные технологии

2

3 Эволюция СУБД

Эволюция СУБД

СУБД первого поколения – иерархические или сетевые, развивались на больших вычислительных машинах – мэйнфреймах семейства IBM-360/370 (отечественные аналоги серии ЕС, производившиеся странами СЭВ) и мини-ЭВМ типа DEC PDP-11 (у которых также был отечественный аналог — СМ-4/СМ-1420) . Для связи записей из различных файлов использовались физические указатели или адреса на диске. Реляционные СУБД появились в 70-х гг., с появлением персональных компьютеров. В середине 80-х годов практически вытеснили с мирового рынка ранние СУБД и наиболее популярны сейчас. Представляют собой множество прямоугольных таблиц с данными. Объектно-ориентированные СУБД хранят данные, не раскладывая их по таблицам

3

4 MS Access

MS Access

Microsoft Access —реляционная СУБД корпорации Microsoft Среди причин популярности следует отметить: рассчитан на работу с пользователями самой различной квалификации, в том числе начинающими популярности достиг после включения в состав Microsoft Office богатый набор визуальных средств разработки Имеет широкий спектр функций, включая связанные запросы, связь с внешними таблицами и базами данных Благодаря встроенному языку VBA, в самом Access можно писать приложения, работающие с базами данных. Может быть использован в качестве клиента Microsoft SQL Server Но: MS Access является файл-серверной СУБД и потому применима лишь к маленьким приложениям. Отсутствует ряд механизмов, необходимых в многопользовательских БД. Использовать защиту на уровне пользователя можно на отдельном компьютере и при коллективной работе - в составе локальной сети.

4

5 Paradox

Paradox

Paradox– персональная реляционная СУБД фирмы Corel (разработка была начата фирмой Borland).

Особенности Paradox: простота и доступность для новичков была очень популярна в конце 80-х – начале 90-х имеет сетевую версию с элементами многопользовательского режима ориентирован на корпоративных пользователей, которые работают с автономными базами данных, а также на пользователей, работающих дома или же в малом бизнесе Но: для баз среднего размера – плохо работает при больших объемах данных многопользовательский режим не рассчитан на большое число пользователей с покупкой Corel динамика обновления снизилась

5

6 Oracle

Oracle

Объектно-реляционная система управления базами данных компании Oracle Кроссплатформенное ПО (Windows, Linux, Mac) Oracle была первой коммерческой реляционной СУБД, поддерживающей ставший ныне индустриальным стандартом язык SQL на базе Oracle следует особо отметить несколько крупных систем управления предприятием, в частности SAP/R3. Имеет бесплатную версию Express Edition с ограниченными возможностями для небольших баз

7 Microsoft SQL Server

Microsoft SQL Server

Система управления реляционными базами данных, разработанная корпорацией Microsoft. Только Microsoft Windows Для больших массивов Имеет бесплатно распространяемую версию Microsoft SQL Server Express. Непригодна для развертывания больших баз данных.

8 PostgreSQL

PostgreSQL

Свободная объектно-реляционная СУБД. Одна из самых старых СУБД, адаптированных в Linux. Курирует разработку известный проф. Стоунбрейкер из Калифорнийского университета в Беркли. Была выведена за пределы университета и передана команде энтузиастов. Кроссплатформенная (Windows, Linux, Mac) Реляционная модель с возможностью наследования свойств объектов (кортежей). Система многопользовательская. Клиент-сервер. Есть транзакционная защита. Отличная документация в формате Postscript. Объем достаточный. Разработана для больших баз

8

9 MySQL

MySQL

Свободная реляционная система управления базами данных Широко используется из-за удобства, простоты и многофункциональности MySQL является собственностью компании Oracle Corporation, Распространяется под GNU General Public License или под собственной коммерческой лицензией. MySQL является решением для малых и средних приложений.

9

10 Delphi

Delphi

http://www.embarcadero.com/products/delphi Быстрота разработки приложения. Использование языка Object Pascal , одного из традиционно изучаемых в России языков программирования. Hизкие требования разработанного приложения к ресурсам компьютера. Hаращиваемость за счет встраивания новых компонент и инструментов в среду Delphi. Возможность разработки новых компонент и инструментов собственными средствами Delphi (существующие компоненты и инструменты доступны в исходниках) Удачная проработка иерархии объектов Возможность создавать приложения как для персональных компьютеров, так и в среде клиент/сервер. В настоящее время Borland поддерживает все ведущие платформы: Java, Microsoft Windows, Microsoft .NET, Linux, Web-сервисы Возможность работы с различными типами баз данных: Acsess, DBASE, Paradox, Foxpro, Oracle и др.

11 Visual FoxPro

Visual FoxPro

http://msdn.microsoft.com/ru-ru/vfoxpro/ объектно-ориентированный и процедурный язык программирования систем управления реляционными базами данных, разработанный корпорацией Microsoft интегрирован с другими продуктами Microsoft, в частности с Microsoft SQL Server Разработка продукта прекращена с выходом SP2 для версии 9.0, поддержка продукта MS будет осуществляться до 2015 года В конце марта 2007 началось организовалось движение испаноязычного FoxPro-сообщества, целью которого стало написание петиции в Microsoft с предложением продолжить работу по обновлению Visual FoxPro или выпустить его в сообщество с открытым исходным кодом.

12 PHP

PHP

Personal Home Page Tools http://www.php.net/ скриптовый язык программирования общего назначения, интенсивно применяемый для разработки веб-приложений. В настоящее время поддерживается подавляющим большинством хостинг-провайдеров и является одним из лидеров среди языков программирования, применяющихся для создания динамических веб-сайтов простой богатая функциональность кроссплатформенность свободное программное обеспечение

13 Паспортная база ГРР ВИР

Паспортная база ГРР ВИР

Дескриптор

За основу взят дескриптор EURISCO, трансформирован для возможности последующего внедрения в GRIN-Global. 26 полей. Например:

13

1

Номер образца (ACCENUMB) Обязательное поле. Допустимые символы – числа. Не может иметь повторений в пределах одной культуры.

2

Оригинальный номер, присвоенный коллектором образцу (COLLNUMB) .

3

Код института, собравшего образец. (COLLCODE) Допустимые значения - коды из справочника “Организации».

4

Экспедиция. (EXPEDITION) Допустимые значения - коды из справочника «Экспедиции ВИР».

5

Таксономия (TAXONOMY) Код из справочника «Таксономия» Обязательное поле.

6

Наименование образца по-русски. (ACCENAME_RUS) Обязательное поле. Допустимые символы – любые.

7

Наименование образца латиницей. (ACCENAME) Обязательное поле. Допустимые символы – любые кроме кириллицы. Местный = Local

8

Дата включения в каталог. (ACQDATE) Возможны 2 формата: Формат ДД.ММ.ГГГГ Опускание нулей и замена точек на др. символы не допускается. Например: 01.01.2000 Формат ГГГГ Обязательное поле.

9

Место происхождения. (ORIGCTY) Обязательное поле. Допустимые символы – числа. Поле содержит код из географического справочника.

DESCRIPTORS

14 паспортная базы данных ВИР http://vir

паспортная базы данных ВИР http://vir

nw.ru/data/dbf_r.htm

14

В настоящее время в Интернет представлено 223617 записей паспортных баз данных коллекции ВИР по 147 культурам. Всего в базе 11 полей. Поиск информации по 9 полям.

Карточка образца

Поисковая форма

15 паспортная база данных ВИР http://vir

паспортная база данных ВИР http://vir

nw.ru/data/dbf_r.htm

Пользователю предлагается: паспортный дескриптор, база данных географических сокращений.

15

16 Европейская база сои

Европейская база сои

На сайте ВИР размещена европейская база сои, содержащая 11915 записей, базы 11 институтов. http://vir.nw.ru/glycine/glycin/find1.php

СУБД postgresql PHP

17 Проект GRIN-Global http://www

Проект GRIN-Global http://www

grin-global.org/

Разрабатывается несколькими международными организациями и правительственными организациями США На основе Североамериканской системы управления ГРР GRIN Современные технологии: работа с координатами, картами, различными СУБД, легкость импорта-экспорта данных Объединяет различные типы данных: паспортные, оценочные, молекулярные, данные инвентаризации (в каких коллекциях находится образец) 1752 поля, 115 таблиц Открытый код. бесплатное ПО: MS SQL Server, C#

User Guide

Iowa State University Sunday, November 14, 2010Presenter: Pete Cyr

18 Проект GRIN-Global http://www

Проект GRIN-Global http://www

grin-global.org/

19 Проект GRIN-Global

Проект GRIN-Global

http://vir.nw.ru/data/dbf_r.htm Написан практикум по элементарным основам работы в системе GRIN-Global, на сайте ВИР обучающий ролик

Разработан тренинг для куратора коллекции ГРР на русском языке http://ru.grin-global.org/index.php/Documentation (ссылка находится на сайте GRIN-Global, документация на сайте ВИР)

19

20 Статистические методы

Статистические методы

20

21 Ресурсы по статистике Электронный учебник по статистике от компании

Ресурсы по статистике Электронный учебник по статистике от компании

StatSoft (Statistica) http://www.statsoft.ru/home/portal http://www.statsoft.ru/home/download/textbook/default.htm Сайт «Биометрика» http://www.biometrica.tomsk.ru/annot1.htm http://www.hr-portal.ru/tool (Statistica, SPSS) Дубров А.М., Мхитарян В.С.,Трошин Л.И. Многомерные статистические методы. М. 2003 Боровиков В. Statistica. Искусство анализа данных на компьютере. Для профессионалов. 2-е изд. Изд-во Питер, 2003, 688 стр. Халафян А.А. Statistica 6. Статистический анализ данных. М, 2010.- 528 с. Резник А.Д. Книга для тех, кто не любит статистику, но вынужден ею пользоваться. Непараметрическая статистика в примерах, упражнениях и рисунках. СПб: Речь. 2008

21

22 MS Excel

MS Excel

Наиболее распространенная программа для создания оценочных и характеристических баз – табличный процессор MS Excel. Плюс: распространенность, дружественный интерфейс, хорошая help-поддержка Минус: не является специализированной статистической программой , некоторые зарубежные издания не признают стат. обработки в Excel ограниченный набор возможностей . MS Excel хорошо подходит для накопления данных, промежуточного преобразования, предварительных статистических прикидок, для построения некоторых видов диаграмм. Существует макрос-дополнение XLSTAT-Pro http://www.xlstat.com для MS Excel который, включает в себя около 100 статистических функций, которых достаточно для обычного применения. Цена: Annual licenses start as low as $50 USD for students, $165 USD for academics and $275 USD for other users

22

23 SPSS

SPSS

SPSS (Statistical Package for Social Science). http://www.spss.ru традиционные пользователи - ученые, работающие в академических институтах и университетах англоязычна я free-trial http://www.spss.com/software/statistics/ Отличается гибкостью, мощностью применим для всех видов статистических расчетов применяемых в биомедицине. Большой выбор расстояний между бинарными переменными (Dice, Jaccard) Русскоязычные версии (с документацией) «SPSS 10: искусство обработки информации. Анализ статистических данных и восстановление скрытых закономерностей», Киев, Диасофт, 2002 Платформа: Windows, MacOSX, Linux Цена: SPSS Named Use Base, пожизненная лицензия, электронная версия 53 900 рублей SPSS Named Use Base, подписка на 1 год 13189 рублей

23

24 STATISTICA

STATISTICA

http://www.statsoft.com мощный пакет компании StatSoft, более 250 встроенных функций http://www.statsoft.com/support/free-statistica-10-trial/ Trial-версия 10,0 http://www.statsoft.ru/ Российское представительство компании предлагает полностью русифицированную 6-ю (должна выйти 9) версию программы Высокий уровень сервиса, дружественный и интуитивно понятный интерфейс информационная поддержка, учебник на сайте совместимость с программами MS Offices быстрая визуализация , сотни типов 2D, 3D графиков может быть рекомендован для биомедицинских исследований любой сложности пакет STATISTICA/w устойчиво занимает лидирующее положение на рынке прикладного программного обеспечение Цена: 45000р для государственных учреждений (базовая статистика + разведочный анализ)

24

25 STATGRAPHICS

STATGRAPHICS

http://www.statgraphics.com Довольно мощная статистическая программа. Содержит более 250 статистических функций Данный пакет популярен, благодаря легкости использования при большой функциональности. Обновляется: Statgraphics Centurion XVI, was released in October of 2009 Есть возможность скачать демо-версию. Есть бесплатная online-версия для обсчета маленьких баз http://www.statgraphics.com/statgraphics_online.htm Цена: $1,495/$1,795 Минус: Англоязычная ограниченный объем переменных для анализа (64 в кластерном) Некоторые виды анализа не работают с пропусками в данных

25

26 Статистические продукты GNU Project

Статистические продукты GNU Project

Движение «Свободное Программное Обеспечение» (Free software movement) Four basic freedoms: the freedom to run it, to study and change it, and to redistribute copies with or without changes R использует в основном командный интерфейс, однако для наиболее популярных приложений создан графический интерфейс Dap свободное замещение SAS PSPP свободное замещение программы SPSS SOFA Statistics (Statistics Open For All). Графический интерфейс (Microsoft Windows, Ubuntu, Linux Mint, and Mac OS X (Leopard and Snow Leopard)) Английский язык Интерфейс командной строкой требует специальной подготовки

26

27 Специализированные программы и методы обработки результатов

Специализированные программы и методы обработки результатов

молекулярных исследований

STRUCTURE DARwin NTSys ARLEQUIN v3.5 BEAST FSTAT 2.9.3 GENEPOP v4.0 MrBayes MSVAR v1.3 PhyML 3.0 Network 4.201

27

28 Программа NTSys

Программа NTSys

Matrix correlation: r = 0.48

Numerical Taxonomy System http://www.exetersoftware.com/cat/ntsyspc/ntsyspc.html Позволяет работать с генетическими и фенетическими данными и сравнивать их. Обрабатывает пропуски Есть учебник Windows Минус: низкий сервис. Цена: $350 ($250 for educational and governmental institutions).

Mantel t-test для сравнения расстояний между образцами по различным характеристикам: близости результатов генетического и фенетического, географического изучения

28

29 Программа DARwin

Программа DARwin

http://darwin.cirad.fr/darwin/Download.php Предназначен для обработки генетической информации. Широкий диапазон возможностей для определения генетических расстояний между образцами, кластерный анализ с бутстреп-оценкой, факторный анализ, позволяет работать с цветом. Современные методы кластеризации дли определения филогенетических связей - Neighbor Joining Распространяется бесплатно Минусы: низкий уровень интерфейса

29

30 Спасибо за внимание

Спасибо за внимание

30

«Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений»
http://900igr.net/prezentacija/obschestvoznanie/sovremennye-subd-i-statisticheskie-pakety-rekomenduemye-dlja-raboty-s-geneticheskimi-resursami-rastenij-151285.html
cсылка на страницу

Общество

18 презентаций об обществе
Урок

Обществознание

85 тем
Слайды
900igr.net > Презентации по обществознанию > Общество > Современные СУБД и статистические пакеты, рекомендуемые для работы с генетическими ресурсами растений